系徽是以會計恆等式

資產(Assets) = 負債(Liabilities) + 股東權益(Stockholders' equity) 的意涵為出發，

而中間的T形代表帳務基礎架構T字帳，左邊是借方，右邊是貸方。

此外，系徽還有第二層的意義：

為因應現代社會資訊化及國際化的潮流，

左邊的A為Accounting，A與中間的地球代表慈濟會計資訊系是一個具有現代國際觀的學

系。

右邊的L和S則為：
麻花辮的L，是以結繩象徵會計資訊系全體師生的團結奮鬥、分工合作及努力不懈的精神；
猶如Dollar符號($)的S，代表著專業會計人員有著卓越的金錢觀和正確的理財觀念，意味著現代會計也跨越財務金融的領域。

最後外形猶如盾牌的徽章，就好比會計法規，保障著會計人員在職場上的權利義務，也可以作為指導會計人員在專業領域中的行為與準繩。